重庆医科大学实验动物中心应学校教学、科研、医疗等工作对合格实验动物和动物实验设施的需求而设置。现有设施面积6000平方米，小鼠、大鼠取得重庆市科技局颁发的SPF级动物生产及动物使用许可证，实验兔、豚鼠、猪、犬、羊、猴、禽类等取得动物使用许可证，现有近15000个小鼠、大鼠、豚鼠、兔、犬等动物饲养笼位。2010年重庆市科学技术委员会批准建立重庆啮齿类实验动物工程技术研究中心。2019年获批为中国实验动物学会继续教育培训基地。2022年成为重庆市实验动物技术协会的挂靠单位。

中心现有员工50余人，其中在编人员10人，7人具有博士学位，博士研究生导师1人，硕士研究生导师4人。2006年获得动物学专业硕士学位授予权，开设《实验动物学》、《医学实验动物学》、《动物生物学》等课程。主编或参编专著教材17部。近五年来，承担国家及市级等科研课题20余项，科研经费近200万元，发表论文60余篇，SCI收录论文30多篇，获发明专利4项，牵头编制国家标准1项。

中心具有细胞培养室、分子生物学实验室、病理切片室、实验动物质量检测室、生物净化平台等。拥有全套动物行为学、小动物活体成像仪、数字X光机、移动B超、全自动血液生化仪等仪器设备，能够开展实验动物教学培训、科学研究、质量检测、动物实验技术及医疗服务等相关工作。